A novel quantile regression approach to define optimal ecological niche: a case study on habitat suitability of cockle populations (Cerastoderma edule) - Normandie Université
Pré-Publication, Document De Travail Année : 2024

A novel quantile regression approach to define optimal ecological niche: a case study on habitat suitability of cockle populations (Cerastoderma edule)

Une nouvelle approche de régression des quantiles pour définir la niche écologique optimale : une étude de cas sur l'adéquation de l'habitat des populations de coques (Cerastoderma edule)

Résumé

Correlative Species Distribution Models (SDMs) are powerful tools for understanding the spatial structure of ecological patterns and serve as a foundation for predicting the short-term effects of environmental changes on biological populations and for improving ecosystem management. However, due to complex and often non-linear interactions between biotic and abiotic factors, as well as irregular data distributions, SDMs are notoriously challenging to construct and validate, highlighting the need for continued research and methodological advancements in this active field of study. Quantile regression is a promising statistical technique to improve SDM as it can deal with data heteroskedasticity and provide a description of habitat suitability consistent with Liebig's Law of the Minimum. The aim of this study is to propose a tool for assessing habitat suitability of an estuary for a species, by defining its optimal ecological niche, which can be used for estuarine management, with a study case of Cerastoderma edule in the Seine estuary. The method involved applying quantile regression to a 20-year biological dataset coupled with a hydro-morpho-sedimentary model data set validated over a 25-year period, both at the scale of the estuary. To account for the complex distributional shapes, this study was carried out comparing three different types of equation (linear, Gaussian and B-spline). On the basis of a preliminary multivariate analysis of the physical descriptors, two models were built representing hydrodynamic, morphodynamical and sedimentary features: daily maximum current speed, inundation time and daily salinity range or mud content as a third predictor. The Gaussian quantile regression produced the best description of the optimal niche, at the 97.5th centile and using the biomass. The optimal ecological niche for C. edule appeared to be lower intertidal marine areas, with low current speed, low salinity fluctuation and a sediment bed composed of muddy sand in the Seine estuary. The calculation of suitability index in this ecosystem was explored over a period of 25 years and analysed in isolated sectors to be applied in different scenarios related to global warming. The model using daily maximum current speed, inundation time and daily salinity range was also applied to data from the Scheldt basins, to test the reliability of the model, thus demonstrating that the model performs quite well, even though there were some differences of habitat suitability between these estuaries. This approach can allow direct comparisons of SDMs with one single Gaussian model and may offer new perspectives to investigate SDMs on a large scale.
Les modèles corrélatifs de distribution d'espèces (SDM) sont des outils puissants pour comprendre la structure spatiale des modèles écologiques et servent de base pour prédire les effets à court terme des changements environnementaux sur les populations biologiques et pour améliorer la gestion des écosystèmes. Cependant, en raison d'interactions complexes et souvent non linéaires entre les facteurs biotiques et abiotiques, ainsi que de distributions de données irrégulières, les SDM sont notoirement difficiles à construire et à valider, ce qui souligne la nécessité de poursuivre les recherches et les avancées méthodologiques dans ce domaine d'étude actif. La régression quantile est une technique statistique prometteuse pour améliorer les SDM, car elle peut traiter l'hétéroscédasticité des données et fournir une description de l'adéquation de l'habitat conforme à la loi du minimum de Liebig. L'objectif de cette étude est de proposer un outil permettant d'évaluer l'adéquation de l'habitat d'un estuaire pour une espèce, en définissant sa niche écologique optimale, qui peut être utilisé pour la gestion de l'estuaire, avec un cas d'étude de Cerastoderma edule dans l'estuaire de la Seine. La méthode consiste à appliquer la régression quantile à un ensemble de données biologiques sur 20 ans couplé à un ensemble de données d'un modèle hydro-morpho-sédimentaire validé sur une période de 25 ans, tous deux à l'échelle de l'estuaire. Pour tenir compte des formes complexes de distribution, cette étude a été réalisée en comparant trois types différents d'équations (linéaire, gaussienne et B-spline). Sur la base d'une analyse multivariée préliminaire des descripteurs physiques, deux modèles ont été construits pour représenter les caractéristiques hydrodynamiques, morphodynamiques et sédimentaires : la vitesse maximale journalière du courant, le temps d'inondation et la plage de salinité journalière ou la teneur en vase comme troisième prédicteur. La régression quantile gaussienne a produit la meilleure description de la niche optimale, au 97,5ème centile et en utilisant la biomasse. La niche écologique optimale pour C. edule semble être les zones marines intertidales inférieures, avec une faible vitesse de courant, une faible fluctuation de la salinité et un lit sédimentaire composé de sable vaseux dans l'estuaire de la Seine. Le calcul de l'indice d'adéquation dans cet écosystème a été exploré sur une période de 25 ans et analysé dans des secteurs isolés afin d'être appliqué dans différents scénarios liés au réchauffement climatique. Le modèle utilisant la vitesse maximale quotidienne du courant, le temps d'inondation et la plage de salinité quotidienne a également été appliqué aux données des bassins de l'Escaut, afin de tester la fiabilité du modèle, démontrant ainsi que le modèle fonctionne assez bien, même s'il y a des différences d'adéquation de l'habitat entre ces estuaires. Cette approche peut permettre des comparaisons directes des SDM avec un modèle gaussien unique et peut offrir de nouvelles perspectives pour étudier les SDM à grande échelle.
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Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-04438267 , version 1 (05-02-2024)
hal-04438267 , version 2 (13-11-2024)

Licence

Identifiants

Citer

Amélie Lehuen, Chloé Dancie, Florent Grasso, Sven Smolders, Francesco Cozzoli, et al.. A novel quantile regression approach to define optimal ecological niche: a case study on habitat suitability of cockle populations (Cerastoderma edule). 2024. ⟨hal-04438267v2⟩
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